AI for Biology

• 蛋白质结构预测：AlphaFold 1/2/3、ESMFold、共进化分析、MSA transformers
• 蛋白质设计：逆折叠（ProteinMPNN）、用于蛋白质生成的扩散模型（RFDiffusion）、幻觉（hallucination）
• 药物发现：分子表示（SMILES、图）、分子性质预测、虚拟筛选、分子对接
• 生成化学：分子生成（VAE、GAN、扩散模型）、逆合成预测
• 基因组学：DNA序列建模（Enformer、Hyena DNA）、变异效应预测、CRISPR引导设计
• 单细胞分析：scRNA-seq、细胞类型聚类、轨迹推断
• 医学影像：放射学（CheXNet）、病理学（全切片图像）、分割（nnU-Net）
• 临床NLP：医学实体提取、临床试验匹配、电子健康记录